Top-Blower und normale Tower-Kühler unterscheiden sich grundsätzlich durch die Laufrichtung ihrer Lüfter.
Top-Blower pusten Richtung Platine und können daher auch die Kühlkörper auf dem Board selbst (sofern vorhanden) unterstützen. Dieses Konzept wird zum Beispiel bei OC, in kleinen, stickigen Gehäusen oder bei billigen Boards mit unzureichender Mosfet-Kühlung empfohlen (insbesondere bei FX-Prozessoren).
Normale Tower-Kühler hingegen befördern die Luft direkt Richtung Heck und harmonieren daher meist besser mit dem Airflow im Gehäuse. Hier finden sich meist auch die potenteren, voluminöseren Kühlkörper.